【6.12】事件发生

同一时间，疑似红色龙的生命体（以下简称「龙」）出现，与巨人交战。其攻击原理及效果不明。

关于攻击龙和巨人的方法，自卫队内部展开紧急讨论。内阁设立紧急对策室。

同日16时许。在与龙的交战中，巨人崩坏。另外，巨人倒下时没有从其身上观测到质量，对地面造成的伤害比较轻微。

巨人崩坏后，「航空自卫队 第6航空团 第303飞行队：Scarface机」把龙击落。龙的尸骸被政府秘密送往研究设施。

之后该事件被称为【6.12】。事件中有56人死亡，重伤、轻伤者320名，造成经济损失超过600亿日元。

政府对【6.12】中无法解释的现象下封口令，但消息很快就在网络等媒体上扩散。出现恐怖袭击和他国阴谋论等说法，引起大混乱。

美国认为这是恐怖袭击，对假想敌国表现出强硬姿势（向日本政府暗示应考虑大幅增加军费）。

针对怪病的研究开始（一开始被认为是只在特定条件下才发病的罕见病，持乐观态度）。

世界各国对日本施压，要求其查明病因。

东京都政府迁移。同时，提议迁移永田町（国会地点）及皇宫，遭宫内厅否决。

永田町议员席出现空缺，剩下的议员表示连任。

人道主义组织表示反对，爆发示威游行。从新闻调查来看，最初社会上多数人反对（但网上赞成意见居多）。

某要人在新宿被凶暴化的白盐化症候群暴徒袭击死亡。在传媒煽动下，舆论一致倾向赞成封锁新宿区。

设置「耶利哥之壁」

发表声明，继续镇压白盐化症候群的凶暴化患者（世界各国发生示威游行。各国对日本的指责声音四起）。

影像中出现巨大白色生物，伴随着悲鸣中断。影像没有被播放（但在网上流出）。

日本政府表示白盐化症候群的感染情况暂时缓和（继续进行对该病的研究）。

（认为部分染色体有轻度异常的人凶暴化可能性较高）

研究结果没有发表，但更加秘密地进行了调查（后来明确了该研究结果是根据捏造的数据而得出的错误结论）。

虽然守住了龙尸骸，但有传言说事件背后有宗教团体、北美国家在操控。此事件后，自卫队的行动开始过激化。

确认「Legion」和「Red eye」的存在

自卫队开始进行「Legion驱逐作战」

从耶利哥之壁内侧出现了大量白色的凶暴怪物（以下称为「Legion」）。无差别地攻击人类，杀戮惨剧重复上演。

有人目击到Legion中出现了秩序，率领它们的是红色眼睛的怪物（以下称为「Red eye」）。

自卫队以Legion和Red eye作为对象，展开「Legion驱逐作战」。

在Red eye的指挥下，Legion的行动有了组织性，驱逐作战变得非常困难。

以九州、北海道为目的地的逃亡者增加。也有人逃往国外，但各国实施拒绝日本入境者的政策。

混乱之中罪案频发。来自海外社会的干涉与日俱增。日本政府陷入困窘状态。

美国提出签订军事协议，但内容对日本十分不利（其他国家表示反对）。

美国把Legion的尸体以及捕获者一同带回国，用作军事目的。此为美国参加战线的理由。

美军登陆日本。与自卫队协力，扩大对Legion的战线。人类一方占据优势。

向新宿同时进行炮击，但Legion的数量几乎没有减少。

在美国的Legion研究虽在进行，但不明确有效对抗手段。

公布核攻击作战。在国内既有赞成也有反对，但国际舆论偏向赞成。

以新宿为开端，真正开始核攻击。日本全国逐步沦为焦土。

新宿毁灭。被称为「Ground Zero」。

被以为已经消灭的「Red eye」确认生存。

对来自异世界的末端干扰进行研究，发现了本来在这个世界不可能存在的粒子。

该粒子是【6.12】的巨人崩坏时身体上的粒子。此后，该粒子被称为「魔素」。

公布研究结果，白盐化症候群的起因就是这种魔素。

热、核等物理攻击手段无法消灭因魔素而出现的白盐化。

（讽刺的是，因为核攻击的冲击而造成魔素在全世界扩散，世界规模的白盐化症候群蔓延）

该病的感染途径为体液和排泄物。作为感染源的魔素可以藏在咳嗽和唾液之中，等同于可通过空气传播。

继续进行多元世界的研究，「所有多元世界一起，能量可被保存」的假说得到证实。

龙尸骸遗失，事件背后有宗教团体和北美国家在操纵的谣言出现（纯属推测）。

结果只有含糊不清的报道，而关于事件的情报更是完全没被报道。

Gestalt化的人体实验成功。同一时期，让Gestalt化的人返回原本身体的实验也成功了。

（但是，能够使用魔法的，仅限于拥有龙的培养组织、得到了跨越分隔多元世界壁障的力量的Gestalt）

参加了作战的Gestalt自我责备过度而精神崩溃。

（他们认为Legion本来是人类，跟灵魂受到干扰的自己境遇相似）

研究本身仍在继续，进入新阶段，研究如何解决Gestalt化灵魂失去肉体的问题。

军队对Legion实行驱逐作战，取得成功。之后此举被世界各地仿效。

以歼灭Legion为目的的「第1次十字军」被派往巴西。在与Legion的交战中全员壮烈牺牲。

组织「第5次十字军」，成员几乎是十几岁的孩子。

国际组织「Hameln机关」成立，从世界各地挑选身体能力强的孩子，作为战斗机器来培育。

「国立兵器研究所」成立（主要目的是制造经由人体实验而强化的人），进行魔素的基本研究及魔素在兵器上的使用实验。

研究所的存在被列为机密事项。在政府内的代号为「紫」。

（但是在没有更好对策的情况下，只能继续派遣十字军）

孩子占人口多数的国家在Hameln机关内有更大发言权。

日本经济变弱，残存的人多数以九州为中心生活。

从Gestalt化人的身体抽取信息，以此为基础造出的容器，被称为「Replicant」。

关于Replicant化的技术，被作为「Gestalt计划」的一环而继续研究。

明确了魔素对人体实验造成的危险，研究受挫。研究所规模大幅缩小。

因为拥有意识的Red eye全灭，Legion的行动失去统一管理。

十字军队长在与Red eye的战斗中负伤，后死亡。

把人类Gestalt化，然后制造出Replicant。建立名为「Replicant System」的系统，半永久地重复以上工作。

成功向无意识的Replicant灌输了讨伐Legion和维持Replicant System这两个活动目的。

Gestalt计划进入最终阶段。把讨伐Legion的任务交给Replicant，在怪病从世界上消失之前一直沉睡。

作为Replicant System的管理者、能半永久持续行动的「Android」被配置到世界各地。

Replicant听从Android的指示，收集魔素。收集的魔素作为Android司祭的原料，在名为「祭」的仪式中放出到异世界。

因为费用高昂，这时候能Gestalt化的只有一部分上流社会人士。

利用黑之书和白之书同时起动所产生的巨大能量，让Gestalt强行回到Replicant之中。此为「黑之书计划」。

计划是，当Legion和白盐化症候群从世界上消失后，利用这个系统，让Gestalt回到Replicant之中。

2053

Nier（兄）和Yonah Gestalt化

根据解析结果，如要使Gestalt化的灵魂安定，则需要从Gestalt化后仍能维持安定的个体中抽取魔素。

世界净化机关为了找出安定个体，把「黑之书」的特殊克隆本派给穷人们。增加Gestalt，从中寻找不会崩坏的个体。

（计划由「Hameln机关」实施）

过着贫穷生活的Nier，为了治好Yonah的病而被骗去参加实验。然而看到周围的人相继变成崩坏体后，感觉到了实验的危险性，于是逃离Hameln机关的设施。

Nier和Yonah在逃亡中，在新宿的超市里被崩坏体袭击。Nier为打开困局，反而主动选择Gestalt化。

Nier保有了自我意识，Gestalt化成功。

Yonah也因事故而Gestalt化，开始变成崩坏体。

Hameln机关接触Nier。以「只要冷冻Yonah，1000年后病就会从世界上消失了」来说服Nier。免费让Yonah冷冻1000年，与之交换的是Nier提供魔素（使Gestalt化的灵魂保持自我的魔素）。

Nier答应世界净化机关提出的条件，作为「Original Gestalt」提供魔素。

最初是像小孩般的意识，但迅速发展，变成接近大人的思考方式。

前后

居住的土地已经改变，文化和文明飞速发展（比中世纪稍先进，基本上依靠过去的遗留物生活）。

年轻人的目的是「让死去的恋人（Replicant）复活」。如他所愿，从最后一个Red eye那白茧般的尸骸中，恋人突然复活了。

复活的恋人有一双红眼，几乎失去了自我意识，以压倒性的力量把年轻人当场杀死。此后，作为新的Red eye统领Legion。

某个Android和4个Replicant一起挑战Red eye，后者战败。消灭全部Legion，把魔素归还到异世界。确认世界被净化。

Replicant和Gestalt的交战开始（在Android支配力量教强的一部分地方，Replicant听从了接受Gestalt的指示，后者成功变回人类）。

前后

在此期间，即使吸收了Nier的魔素，Gestalt中也开始出现凶暴化崩坏体。

这时，1000多年来持续提供魔素的Gestalt Nier开始发觉到如此下去Yonah不会复活的事实。

3465

Replicant Nier（兄）得到白之书

「Android」Devola和Popola，按照「世界净化机关」设定的程序，认定Gestalt Nier是Gestalt的救世主，给予其辅助。

在Devola和Popola的引导下，「Replicant Nier」得到白之书。Devola和Popola让他收集「Sealed Verses」，通过与黑之书融合来实现黑之书计划。

Gestalt Nier不再相信黑之书计划，强夺Replicant Yonah，打算让Gestalt Yonah和自己分别回归Replicant的身体。

在「魔王之城」，Replicant Nier与Gestalt Nier正面交锋。Replicant Nier击败Gestalt Nier，也因为Gestalt Yonah自愿消失，Replicant Yonah得以恢复意识。

作为Original Gestalt的Gestalt Nier死亡，Gestalt计划不得不停顿。人类灭亡在所难免。