游戏中，埃及艳后克利奥帕特拉最后跟着凯撒走了，没多久当上了寡妇，凯撒被八爷媳妇艾雅刺杀，最终艳后也被刺客刺杀而死，被阿玛乌奈特。

据称：阿玛乌奈特很有可能是艾雅。

背景：古埃及其实自波斯大统一时代就覆灭了，波斯被大帝灭国后，埃及沦为雅典的一部分，大帝死后，帝国分裂，埃及被分割为托勒密王朝，实质上依然是雅典人统治。艳后是十三世，被强迫和他弟弟结婚并共同统治埃及，他们实际上是雅典人后裔。

这次《刺客信条:起源》的故事背景就是发生在这位女王统治埃及的时期，想必玩家在游戏中一定会有和这位女王接触的剧情。

《刺客信条：起源》剧情中的部分元素，主角Bayek和埃及艳后克利奥帕特拉的邂逅。据介绍，Bayek初见克利奥帕特拉是在她被弟弟托勒密的顾问们放逐之后。而这些顾问们其实也是“远古骑士”(Order of the Ancients，圣殿骑士在埃及的分支)的傀儡，后者企图控制埃及全境。

《刺客信条：起源》也会重现一些重要的历史事件，例如亚历山大战役(凯撒与托勒密十三世党羽展开的决战，托勒密死于此役，此后克利奥帕特拉掌握了埃及的统治权)。

克利奥帕特拉七世有一点很不同寻常——在当时，她是唯一一位独揽大权的女性统治者。虽然她的兄弟曾和她一同执政，但她无疑拥有更强硬的手腕——并且甚至暗杀了其中一人。后来，她生了一个儿子，但他只是个婴儿，因此，她的统治仍在继续。在她即位之前，埃及王国已经有几十年名存实亡，但她却改变了这个局面。

在克利奥帕特拉的时代，埃及王国恢复了200年前的版图。

按照游戏设定，女王实际是死于刺客之手，而为她带去毒蛇的那个人，就是阿玛乌奈特。