故事背景

很久之前，世界出现四道希望之光。人们向光聚集，构筑了四座圣柜。

圣柜是人们的信仰和秩序，也是应该走的四条道路。

其一为朱雀，翱翔心际的火焰之翼。

其二为白虎，拥抱知识的钢铁之爪。

其三为苍龙，横跨天空的无秽之瞳。

其四为玄武，秘藏刀刃的坚牢之盾。

而当9和9迎来9之时，根源的意志给予世界“菲尼斯”。

世界名为“奥利恩斯”，这是于轮回之中等待“阿基托”的世界。

鸥历842 年水之月，拥有圣柜白虎的米利帝斯皇国在希德元帅的带领下，对邻国朱雀领鲁布路姆展开闪电侵略。

米利帝斯皇国在发布宣战布告的同时，将集结于国境附近的主力舰队开向鲁布路姆各地，对保存朱雀水晶的的朱雀首都魔导院展开奇袭。面对以魔导装甲为主力的皇国军，圣柜朱雀则是以“魔法”与“军神”（召唤兽）来应战。

召唤兽压倒性的威力甚至凌驾于皇国军战舰之上，看来似乎能在最后一刻阻止皇国军的奇袭。不过皇国军的鲁西•昆米率领一支特殊部队钻了空子，投入新武器“水晶干扰器”，使得朱雀水晶的能量无效化，阻断了朱雀军队的魔力来源。

皇国元帅希德对朱雀174代院长卡里亚提出了朱雀全军在6小时内解除武装，并引渡水晶的要求。

游戏主角是12名在魔导院0班就读的候补生，原本以成为传说救世主“觉醒者”为目标的少年少女，为了对抗入侵朱雀领进逼魔导院的皇国军，毅然组成小队奔赴战场。