现代2的故事：

现代1事件5年后，这其中发生了不少事情：俄罗斯的激进势力上台，政局被极端分子掌握，本应是极端恐怖分子的扎卡耶夫，却被宣传成立新的俄罗斯英雄。他原来的得力助手，弗拉基米尔·马卡洛夫成了极端势力的新领袖，并打算继承扎卡耶夫的遗志——重塑俄罗斯当年的辉煌，哪怕因此把世界拖入地狱。世界形式再次变得严峻起来。

为了应对，英国SAS和澳大利亚SASR提出组建多国联合特遣队，打算组建全是由最精锐军人组成的反恐队伍。最后确定该组织命名为141特遣队（以现实中的TF121为原型，没错，就是抓到萨达姆并干掉本拉登的那支部队），以SAS为核心，其余成员从澳大利亚SASR、美国三角洲部队、海豹突击队、加拿大第2联合特遣部队中挑选，推断成员在85人左右。CIA提供情报支持，武器装备及补给、人员运输、火力支援等由美军（主要是美国海军）提供，141的指挥官为5年前才加入SAS的菜鸟，现在已经成长的非常可靠的“肥皂”——麦克.塔维什,而副指挥官则是SAS另一牛人Ghost（幽灵、此人在二楼介绍）。直接领导人为美军三星中将谢菲尔德将军。

为了制造俄罗斯崛起的机会，马卡洛夫自导自演了一场莫斯科机场大屠杀(说英语、使用美式武器枪杀平民)，被谢菲尔德亲自挑选进CIA的美军卧底——新兵约瑟夫·艾伦，被马卡洛夫枪杀，尸体被留在原地。俄罗斯政府误以为是美国的故意挑衅，利用从坠落的美军卫星上得到的ACS控制模组，瘫痪了美军卫星网络，派出大军侵入美国本土报复，在没有准备的情况下，美国大面积领土失守。

阻止俄军利用ACS失败的141特遣队，打算执行斩首行动，转头抓捕马克洛夫。通过机场遗留的子弹，找到了为马卡洛夫提供武器的一名巴西军火商，但最后并没有任何收获。

俄方的极端举动继续升级，他们劫持了俄罗斯近海的一些使用平台，在上面搭载防空导弹，防止美军的报复。141特遣队在美国海军和海豹突击队的帮助下。清除了这些威胁，并得到一个重要情报：俄罗斯古拉德监狱里，有一个马卡洛夫非常忌惮的囚犯。但众人就出此人，却发现居然是本应早已死去的普莱斯！原来普莱斯当年被救活，但不久后俄激进势力上台，本应是帮助俄罗斯恩人的普莱斯，一下变成了恐怖分子，一直被关押在此。

对普莱斯非常尊重的肥皂，把141特遣队的指挥权交给了普莱斯，而普莱斯和谢菲尔德将军却产生了冲突：谢菲尔德要求141特遣队继续追查马卡洛夫的下落，但普莱斯却打算先解决美国和俄罗斯的战争，哪怕用上极端手段。普莱斯率领141特遣队劫持了一艘俄罗斯的核潜艇，并向美国东海岸的上空发射了一枚载有核弹头的洲际弹道导弹（如果我没记错的话）。导弹爆炸之后，俄罗斯军队由于EMP袭击而瘫痪，美军的局势终于得到逆转。

在谢菲尔德的要求下，141特遣队兵分两路，分别突袭两处马卡洛夫的可能藏身点，却发现都是陷阱。超级牛人Ghost带着负伤的小强一路逃亡，好不容易等到了谢菲尔德带来的支援部队，没想到却被他亲手杀害，情报也落入谢菲尔德之手。

发现谢菲尔德居然是幕后黑手，侥幸生还的普莱斯和肥皂等人，打算对谢菲尔德报复。而谢菲尔德也派遣他秘密组建的部队“幻影”（美军在伊拉克真的有这么支部队，不过全是狙击手）剿杀马卡洛夫和141特遣队剩余生还者，并利用不明真相的美军，发布最高通缉令全球通缉两人。“敌人的敌人就是朋友”，混战中，普莱斯联系上了同样陷入困境的马卡洛夫，抱着同样念头的马卡洛夫，告诉普莱斯，谢菲尔德的秘密基地的位置。

普莱斯和肥皂抱着必死的决心和勇气，潜入秘密基地，杀了个天翻地覆，最后肥皂用飞刀干掉谢菲尔德。重伤的来两人被尼古拉斯救走，暂时逃离了这个乱局。

事情的真相其实是这样，谢菲尔德将军就是五年前负责美军在中东军事行动的总指挥官，同时他也是一名类似扎卡耶夫那样的极端爱国主义者。5年前的核弹事件，他亲眼目睹的几万士兵瞬间死亡，美国的形象也受到了很大影响。谢菲尔德将军更对在极端组织夺取俄罗斯控制权后美国政府的弱势态度表示不满。他决定利用马卡洛夫来挑起战争，至于那个倒霉的约瑟夫·艾伦，就是他故意交给马卡洛夫的。希望在俄罗斯打击下改变美国现颓废的现状且重塑美国的世界霸主形象，然后再想方法铲除马卡洛夫。