三年后的现在

从永真给了只狼一封信开始，唤醒了只狼再次履行约定保护少主的使命。而通过寺庙中与永真的对话发现，这其实是苇名一心的意图，因此来的是苇名一心的专属药师永真。这里不得不说苇名国，苇名国在苇名一心病重后倾颓已经是不可逆转的了，这点从后期同级别小怪上可以感受到，苇名国的忍者也就是前期房顶上的寄鹰众，和后期内府的忍者紫袍的孤影众，实力差距不是一点半点，同理苇名小兵和内府赤备军也是一样。

这样的境地如何救国，大概也就真的只有弦一郎渴求的龙胤，但是苇名一心不想凭借这样的方法救国。其实苇名一心是对的，苇名国的陷落不是只靠龙胤就能挽回的，龙胤只能起到拖延的作用，更何况龙胤要牺牲身边人的性命。另一方面自己建立的国家真的要靠邪道来续命么?与其如此不如顺其自然，但苇名一心深知无法劝说弦一郎，所以只能委托永真让只狼带走九郎从而断绝弦一郎的这个念头。

然后就是弦一郎在苇名城暗道外斩断只狼手臂再次软禁九郎，并封锁了城门和暗道。随后佛雕师将只狼带回了破旧寺庙，等他复活并赐予了道玄制作的忍义手。忍义手的来源在佛雕师喝完酒后会透露，佛雕师曾险些堕入修罗，因此要求苇名一心斩下了自己的手臂，挚友道玄为他制作了忍义手，传手成功。

于是只狼再次踏上了拯救九郎的旅程，在此期间完善忍义手，学各种技能，然后打败鬼刑部打开了通往苇名主城的大门。最后来到在苇名城天守阁上层击败了苇名弦一郎，但弦一郎却事先喝下了变若水并成为了红眼，拥有了再生之力并逃离了天守阁。