Vault 101【辐射3】：101避难所建立于华盛顿特区西北的山中，实际地理位置可能是Virginia北侧的Tysons Corner。101避难所的实验目的是测试Overseer的权威性，这里被设定为永远不会接收到“污染清除”的信号，使避难所无限期与世隔绝，虽然有限的遗传基因有可能会导致近亲繁殖。

101避难所的第二任Overseer决定挑选几个成年人协助他对孩子们隐瞒秘密，这个政策长年执行下去导致每下一代都有更多人了解到避难所的真相。此外，Overseer能够使用位于办公室下的秘密通道去沟通甚至访问外面的世界。然而，对于其他的意图和目的，避难所的居民被封锁在“我们生于此，我们长于此，我们死于此”的循环中。但是，随着独行者【辐射3主角】的逃离，实验进入了一个新的阶段。

从东部钢铁兄弟会总部终端上获得的信息来看，101避难所的早年记录并不完整。对其他文件的分析表明，101避难所应该是建立于2060年左右。

在23世纪中叶，一位新的Overseer成为了避难所的领袖，他是一个支持与外界沟通的人。2241年，Overseer派遣了一支以Anne Palmer为首的侦查分队前往废土。这次探险揭示了战后废土的真正自然状态，并与小城Megaton的人们建立了联系。在独行者之父到达避难所亦即2258年之前，这位Overseer在一次废土探险中消失了。他的继任者Alphonse Almodovar奉行严格的孤立主义，避难所成为了一个严刑峻法的警察管制社会。

在Alphonse刚刚成为Overseer时，James【辐射3主角之父】带着他的婴儿进入了避难所社会。James同意了Overseer的要求，受雇成为避难所的医师，并向他的孩子隐瞒了出身，以为自己和父亲都是生于避难所中。19年后，James突然从避难所中消失，这迫使独行者也要逃离避难所，在躲过保安队伍的杀意之后前往废土去寻找他/她的父亲。

在见过Megaton的Colin Moriarty之后，独行者了解到了自己的身世：他/她是在避难所外出生的，James的妻子因分娩而死，尔后James才将孩子带进了避难所。虽然在避难所中有几个人知道真相比如老太太Palmer，但他们都从未对独行者提起过。

与Megaton的其他人交谈之后，独行者发现过去20年中还有人离开过101避难所。Craterside Supply的店主Moira Brown回忆“大概10 – 12年前有个女孩逃了出来”，而Colin Moriarty则回忆说5年前有人从避难所跑出来。脱逃者对Moriarty说，避难所的居民都被洗脑了，只相信谎言。

实际上，Megaton这个小镇在某种意义上就是因为那些试图进入避难所的人们而建立的。避难所门外至今还有那些不得其门而入的人的尸骨，以及他们措辞严厉的标语牌【例如“我们快死了”“救救我们”“你们这些凶手”等等】。

需要指出的是，在任务“后院起火”【Trouble on the Homefront】中暗示大多数但不是全部避难所居民在参与实验。这可以解释为什么James带着年幼的独行者突然加入避难所没有引起太多居民的关注，而且也能够解释Overseer为何在没有外来者先例的情况下允许两个新来的人加入避难所。

Vault 106【辐射3】：106号避难所关闭10天后，神经毒气通过空气过滤系统被排放到避难所当中。

到2277年，整个避难所已经被严重破坏，但里面仍然满是疯狂的幸存者。神经毒气依旧存在于空气过滤系统中，吸入它的人会突然眼前一蓝，并伴随着幻觉出现。避难所中的计算机终端资料显示，Overseer知道他的居民将面临着什么样的实验，但却让自己的警卫去告诉避难所中的每个人一切正常。在106避难所最后的日子里，它变成了一个类似于洞穴的地方，居民的残骸和各种物品四处散落。