满意度

前作中，玩家的不少决策会影响自己文明的快乐值，不过文明6中的快乐值不再是全文明统一，改名为满意度(Amenities)，且其影响改为各城市独立。这个变化也是平衡文化胜利路线的举措之一。

宗教

文明5资料片众神与君王中的宗教系统将在文明6中得到延续。

玩家可以选择或自己命名宗教，本作中可选的宗教符号比前作更多。每种信仰的特性各不相同，玩家可以选择寄托信仰的建筑类型，比如教堂，清真寺或简单的集会所。每种建筑物有不同的奖励。

宗教仍然通过施加压力传播，圣城(每种宗教的发祥地)提供额外的压力。

国外网站GadgetHelpLine报道，本作中将有宗教胜利路线，宗教可以让玩家生产审判者，使徒等单位，还可以通过宗教热诚占领对手城市。

玩家可以在圣地通过信仰修建教堂，集会所等宗教建筑，还可以用信仰值买到“剧院区”或“商业中心”。 玩家现在可以进行宗教战争了，可以修建“宗教裁判所”，生产“审判者”和“使徒”，宗教战争将另有一番凶险。

外交

随游戏阶段不同，与其他文明的互动也会不同，从初期的原始生存冲突，到后期的结盟与谈判。

文明6中对其他文明宣战，引入“名正言顺”概念，如果玩家有正当的宣战理由，将受到较少的外交惩罚;如果玩家事先不揭发敌人恶行，将视为“毫无理由的战争”，将受到较多的外交惩罚。

本作中没有“世界议会”，这是少数没有从前作中继承的设定之一。

传言

商人，代表和间谍可以收集传言，类似前作中的“密报”，可了解其他文明的动向和计划，以及其领袖的隐藏特征。

玩家可以仅通过“传言”就了解到对手的所有日常，但即使玩家和其他文明关系很好，也还是可以排遣间谍到盟友那里去，以确保获得的信息更完整。

代表

派遣一个代表(需要花25金币)可以稍微促进与其他文明的关系。代表和使者的数量是有限的。

领袖特征

AI控制的文明，其领袖有固定的符合历史的个人特征，以及随机的隐藏第二特征，隐藏领袖特征可以仅仅是“工业爱好者”或“人文爱好者”等这类很基础的东西。

商路

文明6的商路系统延续自前作资料片《美丽新世界》，最大的变化在于贸易单位将自动建立两座城市之间的路。商路形态将根据每个城市的城区而不同。

下图中剑图标旁的数字表示两个城市之间的距离，剑图标只是临时图标，现已改成箭头图标。