◆逃离泽西号而不进入公开冲突

◆刺杀泽西号船长

◆一次通关完成所有条件

海尔森虽死，查尔斯取而代之，成为圣殿骑士的宗师。康纳来到父亲的葬礼，这是找到查尔斯的一个好机会。来到墓地，康纳径直朝发表演讲的查尔斯走去。查尔斯对海尔森的死无比沉痛，发誓会毁掉康纳的一切，杀掉兄弟会的所有人，烧死村落里的族人。

康纳被士兵拖走，在街上摆脱束缚将士兵杀掉，然后回到墓地杀掉这里的十二名士兵，得知查尔斯去了码头。在途中找小贩或杂货商购买毒镖，赶到东部码头爬到海上监狱泽西号上，避开守卫的视线爬到另一侧，偷听窗户里面监狱长和特使的谈话，原来圣殿骑士在监狱的囚犯里招募士兵。接下来要赶往船长的房间偷听，途中有一名站着不动的士兵需要解决掉。透过信使的谈话，得知查尔斯会出现在波士顿的绿龙酒馆。谈话结束船长会走出房间，朝他投掷毒镖，等他毒发倒地再跳入海中。

◆别在追逐过程中推挤任何人

◆别受到任何火焰伤害

◆一次通关完成所有条件

前往绿龙酒馆打探到查尔斯的下落，赶往港口用鹰眼视觉锁定查尔斯，这家伙拔腿就蹽。比较难达成的是保持50米之内的距离，需要选择合适的路线来追赶，并且速度要快，不能被爆炸的木桶拖延。

在开始要躲避右侧爆炸的木桶，被炸到的话会落后10米左右，在之前往左边的步行道跑。再往前会有两名士兵阻挡，这时往左边木板上跑，跑到木船的甲板避开水手，往船头的桅杆上跑，纵身跃到岸边继续追赶。顺利的话，达成保持50米距离和没有推挤到行人的次要目标。

追到船舱后要躲避火焰，在火焰阻路的位置往右转攀上木梁，跳到上层的甲板。再遇火陷，从右侧的窗口跳过去……接下来的追逐是单线的，最后两人跌落船舱，两败俱伤。

数天后，康纳追到一间酒馆里，喝下查尔斯递来的酒，一刀将之毙命，取下他胸前的纹章。半年后，康纳回到村落，发现族人都搬走了，老族母将那只水晶球留给了他。神灵嘱咐他妥善保管好那枚纹章，将它藏到无人知晓之处。回到庄园，康纳将纹章埋到阿基利斯故去的儿子墓中。

回到现实，戴斯蒙循着祖先的记忆，从坟墓挖掘出那枚纹章，用它打开了密室的通路。密室里有着第一文明制造的装置，这时朱诺和密涅瓦都现身了，她们说出了不同的见解。现在摆在戴斯蒙的面前有两种选择：让地球毁灭从而开启一段新的文明，还是避免灾难释放出居心叵测的朱诺呢？