幸福度

前作中，玩家的不少决策会影响自己文明的幸福度，不过《文明6》中的幸福度不再是全文明统一，其影响改为各城市独立。这个变化也是平衡文化胜利路线的举措之一。

宗教

《文明5》资料片众神与君王中的宗教系统将在《文明6》中延续。

玩家可以选择或自己命名宗教，本作中可选的宗教符号比前作更多。每种信仰的特性各不相同，玩家可以选择寄托信仰的建筑类型，比如教堂，清真寺或简单的集会所。每种建筑物有不同的奖励。

宗教仍然通过施加压力传播，圣城(每种宗教的发祥地)提供额外的压力。

国外网站GadgetHelpLine报道，本作中将有宗教胜利路线，宗教可以让玩家生产审判者，使徒等单位，还可以通过宗教热诚占领对手城市。

设计师表示：

玩家可以在圣地通过信仰修建教堂，集会所等宗教建筑，还可以用信仰值买到「剧院区」或「商业中心」。 玩家现在可以进行宗教战争了，可以修建「宗教裁判所」，生产「审判者」和「使徒」，宗教战争将另有一番凶险。

外交

随游戏阶段不同，与其他文明的互动也会不同，从初期的原始生存冲突，到后期的结盟与谈判。

《文明6》中对其他文明宣战，引入“名正言顺”概念，如果玩家有正当的宣战理由，将受到较少的外交惩罚;如果玩家事先不揭发敌人恶行，将视为“毫无理由的战争”，将受到较多的外交惩罚。

本作中没有「世界议会」，这是少数没有从前作中继承的设定之一。

我们改变了领袖们在外交中的行为模式。前作中，所有的领袖都以相同方式进行游戏。现在我们增加了领袖特征，领袖的AI将根据特征以不同的方式进行游戏。我们给每个领袖设定的特征，是根据他们在真实历史中的特点来的。每个领袖有一个符合史实的特征，玩家多玩几遍游戏就能搞清楚;不过我们还给领袖们设置了一个隐藏的特征，需要玩家在游戏中通过谍报活动才能搞清楚。这样外交的场景就很丰富了。游戏中的领袖越多，特征也就越多，这就让外交场景越发有趣。

传言

商人，代表和间谍可以收集传言，类似前作中的「密报」，可了解其他文明的动向和计划，以及其领袖的隐藏特征。

玩家可以仅通过「传言」就了解到对手的所有日常，但即使玩家和其他文明关系很好，也还是可以排遣间谍到盟友那里去，以确保获得的信息更完整。

代表

派遣一个代表(需要花25金币)可以稍微促进与其他文明的关系。代表和使者的数量是有限的。

领袖特征

AI控制的文明，其领袖有固定的符合历史的个人特征，以及随机的隐藏第二特征，隐藏领袖特征可以仅仅是“工业爱好者”或“人文爱好者”等这类很基础的东西。已知的隐藏特征有：

1、想要打造世界上最强的海军

2、想集中资源发展文化

胜利条件

统治 Domination

科学(太空竞赛)Science (Space Race)

文化 Cultural

宗教 Religious

游戏主设计师Ed Beach说了，本作没有世界议会。好像也没有外交胜利Diplomatic，也不清楚有没有得分/时间胜利。

单位堆叠

为了减少地图的拥堵情况，《文明6》中新增了单位堆叠的功能。玩家可以将类似类型的单位或共生单位进行合并，但有数量的限制。例如，战士单位可以和建造者单位合并，以抵御游戏初期的野蛮人，保护建造者。

多人游戏

多人游戏模式的时间将控制在5-10小时，同时新增只需要1-2小时即可完成的多人游戏模式。

游戏界面

屏幕上方第一行显示：科技，文化，信仰，金钱，商路的值，然后是各种资源的数量，回合计数，真实时间，文明百科和选项。 第二行左边：研究，文化，政府，宗教，伟人，巨作；右边：埃及和美国领袖头像，头像上的小图标表示敌对和联盟关系，带装饰的头像是玩家自己文明的领袖；再右边的小图标是：外交，城邦，谍报和贸易。

左下的小地图控制地图信息的显示开关，如资源图标和网格。玩家可以在地图上作标记;网格战略视图类似前作。 右下方的多功能显示为当前选中单位的操作，如单位信息，城市信息，战斗评估等。

日夜循环

游戏加入了日夜循环，如光源和投影的变换，建筑物上的灯光。这项效果可以设置，比如设定一个日夜循环的时间周期，或者随回合切换变化。

战争迷雾

未探索的区域及单位未见之区域，会呈现2D画卷的效果。